НУЦ обеспечивает устойчивость функционирования и безопасного взаимодействия устройств в российском сегменте интернета. Информационная система предоставляет возможность пользователям получать TLS-сертификаты (траст-сертификаты), с помощью которых будет производиться идентификация принадлежащих им информационных ресурсов в ходе электронного взаимодействия. Кроме того, НУЦ позволит обеспечить взаимодействие граждан с информационными ресурсами госорганов по защищенным протоколам и с поддержкой российских алгоритмов шифрования.
Портал в рамках ИС НУЦ призван автоматизировать регистрацию и аутентификацию пользователей, обработку запросов на выдачу траст-сертификатов и их аннулирование, публикацию реестра выданных сертификатов, корневого траст-сертификата системы и актуального списка аннулированных сертификатов.